uniprot怎么下载蛋白序列(如何在uniprot数据库中查找某个蛋白序列)
您好,蔡蔡就为大家解答关于uniprot怎么下载蛋白序列,如何在uniprot数据库中查找某个蛋白序列相信很多小伙伴还不知道,现在让我们一起来看看吧!
1、NCBI NCBI下有很多数据库,以下是蛋白质序列PopSet 包括研究1个人群、1个种系产生或描写人群变化的1组组联合序列。
2、PopSet既包括核酸序列数据又包括蛋白质序列数据。
3、 Entrez 功能强大,在于它的大多数记录可相互链接,既可在同1数据库内链接,也可在数据库之间进行链接。
4、当应用BLAST软件比较某氨基酸或DNA序列与库中其他氨基酸或DNA序列差异即进行类似性检索时,则会触及到蛋白质库或核苷酸库的库内链接。
5、库间链接产生在核苷酸数据库内的记录与PubMed库中已发表序列的引文间的链接,或蛋白质序列记录与核苷酸序列库中编码它的核苷酸序列间的链接。
6、BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是用于序列类似性检索的1个重要数据库,是辨别基因和基因特点的工具。
7、该软件能在15秒内完成全部DNA数据库的序列检索。
8、BLAST记录的相干度有明确的统计学解释,以便更容易地将相干记录与随机的数据库记录像辨别。
9、在NCBI主页的左工具条中,点击BLAST图标,即进入BLAST主页。
10、 BLAST 主页提供了几种BLAST检索软件。
11、其中BLAST2.0是1种新的BLAST检索工具,它在原有基础上作了改进,运行速度更快,灵敏度更高,同时具有Gapped BLAST 和PSI-BLAST两种软件的新功能。
12、Gapped BLAST 允许在对准的序列中引入空位(碱基缺失或插入),引入空位(Gaps)意味着在比较两个相干序列时不会出现中断(Break)现象。
13、这些空位对准的记分系统更能反应相干序列的类似程度。
14、PSI-BLAST的全称是Position-Specific Iterated BALST,即特殊位置重复BLAST,它提供了自动、易用的概貌(Profile)检索,是查找序列同源的有效工具。
15、Dnastar 可以用于解决你踢完的后半个问题。
本文就讲到这里,希望大家会喜欢。
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